ФМБА перешло в подчинение Президенту РФ
В тематическом указе также прописаны поручения правительству – чиновники должны представить предложения по приведению актов Президента РФ и собственных постановлений в соответствие с новым документом.
В январе 2020 года по указу Путина ФМБА было выведено из подчинения Минздрава РФ и передано правительству. В том же месяце ФМБА возглавила Вероника Скворцова, до этого дважды занимавшая пост министра здравоохранения РФ.
Также в начале 2020 года агентство было освобождено от обязанности отчитываться о своей деятельности перед Татьяной Голиковой – вице-премьером, ответственным за здравоохранение. Работу агентства стал курировать Юрий Борисов, тогда в качестве вице-премьера отвечавший за госполитику в сфере промышленности, ТЭК, обороны (сейчас Борисов – гендиректор госкорпорации «Роскосмос»).
В марте 2020 года в структуре ФМБА появился первый национальный медицинский исследовательский центр – статус НМИЦ получил Федеральный научно-клинический центр оториноларингологии ФМБА.
В марте 2021 года Владимир Путин подписал указ, предоставивший ФМБА доступ к государственной тайне. В июне 2024 года правительство создало в ФМБА должность статс-секретаря – заместителя руководителя агентства.
