Фармкомпании основали консорциум по разработке антител с базой на 10 тысяч последовательностей
Apheris обеспечивает федеративную инфраструктуру, позволяющую обучать, тестировать и дообучать ИИ-модели на полном датасете без раскрытия проприетарных последовательностей между участниками. Участники сохраняют права на свои данные и могут применять модели и их доработанные версии внутри своих компаний.
Ginkgo Datapoints отвечает за научный дизайн консорциума – выбор последовательностей, производство антител и высокопроизводительную лабораторную характеризацию по ключевым параметрам разрабатываемости. Компания также обучает базовую модель в защищенной среде Apheris. Независимый научный надзор осуществляют Шарлотта Дин, профессор структурной биоинформатики Оксфордского университета, и Питер Тессье, профессор фармацевтических наук и химической инженерии Мичиганского университета.
Первый датасет планируется передать участникам к началу 2027 года. Консорциум открыт для присоединения других фармацевтических и биотехнологических компаний. В дальнейшем планируется добавить более сложный формат антител для новых классов препаратов. «Чтобы ИИ влиял на решения по разрабатываемости, он должен работать на молекулах самой фармкомпании, – заявил Робин Рем, CEO и соучредитель Apheris. – Федеративная инфраструктура Apheris доставляет модель каждому участнику и позволяет дообучать ее на проприетарных молекулах внутри их собственной среды». Рич Коэн, старший директор Ginkgo Datapoints, отметил: «Мы создаем крупнейший стандартизированный датасет по разрабатываемости антител и прогнозные модели на его основе».
В AbbVie отметили, что консорциум решает ограничения, связанные с «удобными» датасетами, и может ускорить открытие антител. В Lundbeck подчеркнули важность инициативы для сложных терапевтических областей, таких как ЦНС. Takeda указала, что объединение стандартизированных данных позволит строить более сильные прогностические модели и быстрее выводить новые терапии на рынок.
Ранее специалисты Института химической биологии и фундаментальной медицины им. Д.Г. Кнорре СО РАН совместно с коллегами из Италии и США при поддержке Российского научного фонда (РНФ) провели метаанализ 25 исследований и обнаружили связь наличия в крови аутоиммунных антител anti-Ro/SSA, часто выявляемых у людей с системными заболеваниями соединительной ткани, с удлинением интервала QT (QTc), повышающим риск возникновения аритмии. В анализ вошли данные почти 11 тысяч человек, из которых 2,1 тысячи имели anti-Ro/SSA-антитела. У этой группы интервал QTc был больше, а риск его патологического удлинения превышал показатель у anti-Ro/SSA-отрицательных участников более чем в два раза. Результаты опубликованы в European Heart Journal Open.
