Дельта и Омикрон, Альфа и Омега

С самого начала пандемии несколько регионов вызывали у нас особые опасения. В их число, безусловно, входили и Индия, и Южная Африка.

Страны Южной Африки – одни из беднейших стран мира с крайне важной особенностью: высокой долей людей, живущих с ВИЧ: кое-где доля ВИЧ-положительных подростков и взрослых 15-49 лет достигает 18,2-27,6% в ЮАР, Ботсване, Лесото и Эсватини (бывш. Свазиленд) [1]. Несмотря на успехи в тестировании и обеспечении ВААРТ ВИЧ-положительных жителей этого региона (цель 90-90-90), в абсолютных числах количество людей, не знающих свой статус, не принимающих терапию или не достигших неопределяемой вирусной нагрузки, и с весьма высокой вероятностью иммунокомпрометированных вследствие этого, велико.

Как нам известно из множества кейсов [2,3], у таких пациентов возможна персистенция SARS-CoV-2. В случае ВИЧ-инфекции ситуация отягощена тем, что выпадает целое звено иммунитета – T-хелперы – без которого невозможно формирование полноценного иммунного ответа. За время персистенции, измеряемое месяцами, вирус успевает в достаточной мере мутировать, чтобы успеть уйти от начавших появляться антител. Именно поэтому мы увидели такую дисперсию в мутациях: Индия, благодаря высокой плотности населения, дала менее мутантный, но весьма быстро распространяющийся вариант дельта, а ЮАР дала вариант бета – менее патогенный, но хорошо уходящий от иммунного ответа. Вариант дельта оказался настолько успешным, что вытеснил все остальные варианты из поля зрения.

Появление нового варианта, сочетающего оба этих свойства, было достаточно ожидаемым. Эволюционировав – вероятнее всего – в иммунокомпрометированных, он был обнаружен среди полностью привитых в Ботсване [4]. Как сообщается, из трёх заболевших в Израиле один был привит двумя дозами Vaxzevria, один – двумя дозами Janssen, а один – 3 дозами вакцины Comirnaty [5], что особенно настораживает.

Новому варианту была присвоена буква греческого алфавита ο (омикрон). ПЦР-тесты пока что его способны распознать, но по отдельным сообщениям лабораторий один из тестов неспособен обнаружить один из трёх целевых генов [6].

Разработчики вакцин ожидают данных о том, насколько имеющиеся вакцины эффективны против нового варианта, в течение двух недель. Разработка и вывод на рынок обновления вакцины (если таковое потребуется) займёт порядка 100 дней [7].

1. UNAIDS Data 2020, https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/2020_aids-data-book_en.pdf
2. Martin Martinot et al, Remdesivir failure with SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA-polymerase mutation in a B-cell immunodeficient patient with protracted Covid-19, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7543308/