Ученые создали клеточный атлас воспалительных заболеваний кишечника
В ходе создания IBDverse ученые провели секвенирование РНК отдельных клеток крови и биопсию кишечника 421 человека, включая 125 пациентов с ВЗК – болезнью Крона или язвенным колитом.
Исследователи отмечают, что большинство генетических вариантов, связанных со сложными заболеваниями, расположены в некодирующих участках генома, что затрудняет поиск генов, влияющих на развитие патологии. Использование методов одноклеточного анализа позволило определить клеточно-специфические генетические эффекты, которые ранее оставались незамеченными при исследовании тканей в целом.
Ученые сопоставили генетические вариации с особенностями экспрессии генов в различных типах клеток. Это позволило определить предполагаемые гены-эффекторы более чем для половины из 321 известных генетических локусов, связанных с ВЗК. Для 74 локусов такие гены были выявлены впервые.
Значительная часть обнаруженных генетических эффектов была связана с иммунными клетками, прежде всего дендритными. Исследователи установили, что ряд генетических изменений приводит к снижению активности сигнального пути Notch, играющего важную роль в регуляции иммунного ответа в кишечнике.
Кроме того, ученые выявили нарушения в работе генов, регулируемых сигнальным путем Wnt, в эпителиальных стволовых клетках и клетках-предшественниках в кишечнике. По мнению авторов работы, это может ухудшать процессы обновления тканей, ослаблять барьерную функцию кишечника и повышать восприимчивость к заболеванию.
Как считают исследователи, результаты работы могут иметь значение не только для изучения ВЗК, но и для создания лекарственных препаратов. В частности, анализ помог выявить возможное объяснение желудочно-кишечных побочных эффектов ряда препаратов, широко применяемых для лечения сахарного диабета 2-го типа.
Авторы также отмечают, что разработанный подход может использоваться для изучения других заболеваний, включая астму, псориаз и эндометриоз, поскольку позволяет связывать генетические факторы риска с конкретными клетками и биологическими механизмами развития болезни.
В мае 2026 года Барселонский центр суперкомпьютерных вычислений (BSC-CNS) представил крупномасштабный атлас старения женской репродуктивной системы. По данным исследования, разработка впервые дает целостное представление о возрастных изменениях и их связи с менопаузой. Ученые реконструировали траектории старения семи органов, включая яичники, матку, влагалище и молочную железу, сопоставив морфологические изменения с экспрессией тысяч генов, и пришли к выводу, что старение протекает неравномерно: яичники и влагалище начинают изменяться задолго до менопаузы, тогда как матка демонстрирует более резкую перестройку в этот период.
