Связанные с раком генетические вариации объединили в базу данных

Специалисты из Национального института рака США (NCI) создали крупнейшую в мире базу данных генетических вариаций, связанных с онкологическими заболеваниями, и сделали ее доступной для всего научного сообщества, сообщает журнал Cancer Research, издаваемый Американской ассоциацией раковых исследований.

Доступ к базе осуществляется через два портала — CellMiner и Ingenuity systems.

База содержит шесть миллиардов элементов данных, связывающих 103 уже применяющихся в клинической практике и 207 находящихся в разработке лекарственных препарата с генетическими вариантами, полученными в результате полногеномного секвенирования 60 линий раковых клеток. Клетки принадлежат девяти видам злокачественных новообразований — раку молочной железы, яичников, простаты, прямой кишки, легких, почки, головного мозга, крови и кожи.

Составленный каталог позволяет изучать и прогнозировать чувствительность раковых клеток с канцероспецифичными генетическими вариациями к лекарствам. Как рассчитывают в NCI, база данных позволит значительно повысить уровень понимания механизмов канцерогенеза, возникновения резистентности к препаратам и ускорить процесс разработки противораковых лекарств точечного действия.