«Среднеазиатский» и «российский» ВИЧ образовали новый агрессивный вид вируса

Один из ведущих вирусологов России, заведующая лабораторией ретровирусов Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора (Новосибирск) Наталья Гашникова рассказала о тайной жизни этих вирусов.

«Разновидностей ВИЧ множество: так же, как люди делятся на разные расы, национальности, так и разные вирусы иммунодефицита различаются по структуре генома — генетического кода, который содержит всю информацию о вирусе. Геном вируса — это как хромосомы у человека, в которых зашифрована вся генетическая информация (какие у вас глаза, губы, рост и т. д.). Молекулярные эпидемиологи расшифровывают генетические коды вирусов и с помощью компьютерных программ сравнивают их, объединяя вирусы по идентичности их генома. Близкие группы вирусов называют субтипами.

Генетическую классификацию ВИЧ ввели вскоре после его открытия. Сначала определили девять основных групп, субтипов — A, B, C, D и т.д, и думали, что на этом все закончится. Но уже в начале 2000-х годов стало очевидно, что ВИЧ меняется. Когда вирус попадает в клетку человека, каждый цикл своего воспроизведения он делает с ошибкой. Считается, что без терапии у одного человека в сутки воспроизводится 10 в десятой степени новых вирусов. И каждый раз вирус при копировании своего генома может делать ошибку — так накапливаются точечные мутации», — пояснила специалист.

Но, кроме этого, оказалось, что вирусы могут и взаимодействовать друг с другом. Если в клетку человека попадает один вирус, а через какое-то время он заражается еще раз уже другим генетическим вариантом вируса (сначала был вирус, условно говоря, голубой, а потом попал красный), то такие вирусы могут частично обмениваться кусками своей информации (в результате может получиться уже вирус с мозаичной структурой генома, где чередуются красный и синий цвета). Это называется рекомбинантный вариант ВИЧ.

Такие варианты стали регистрировать еще в начале 2000-х годов, и некоторые рекомбинантные варианты получили очень широкое распространение в международной эпидемии — пандемии. Например, вирус CRF01_АЕ (это значит, что его прародительские формы — субтипы вируса А и Е), CRF02_AG, CRF03_АВ и т. д.

Сейчас в мире описано около 90 разных рекомбинантных форм вируса. Какие-то получают очень широкое распространение, а какие-то выявляются, но не дают большого «вклада» в эпидемию.

В России очень долго, примерно до 2008 года, почти на всех территориях распространялся вирус субтипа А. Он распространялся в обычной популяции (наркоманы и люди, получившие ВИЧ половым путем). Исключение составляли мужчины гомосексуальной ориентации, в группе которых циркулировал другой вирус — субтипа B: так сложилось исторически, потому что именно этот вирус в свое время попал в такую группу людей. Но сейчас ситуация очень сильно изменилась

«Мы, вирусологи «Вектора», постоянно занимаемся мониторингом циркулирующих ВИЧ. Организация находится в Новосибирске, поэтому данный регион (Новосибирская область) был нами максимально изучен. Тем более что мы с областным центром СПИДа находились на одной территории и у нас было налажено очень тесное сотрудничество. Начинали, когда в городе было еще всего 16 ВИЧ-инфицированных (а сейчас их примерно 36 тысяч). Ежегодно мы собирали образцы крови от недавно выявленных больных, расшифровывали фрагменты генома и анализировали, какие разновидности ВИЧ у нас выявляются. Именно это позволило нам в 2006 году зарегистрировать появление новой разновидности вируса. Мы не сразу поняли, что это новый вирус — технологии тогда еще не позволяли, секвенирование (расшифровка генома) было очень дорогим, малодоступным. Сначала мы думали, что мы увидели вирус, который, по данным научной литературы, выявлялся в странах Средней Азии — в Таджикистане, Узбекистане, Киргизии, Казахстане.

Но, кроме расшифровки генома, мы проводим еще и филогенетический анализ (специальная программа рисует «деревья» с ветвями, на которых объединяются близкие разновидности вируса). Расшифрованные последовательности образовывали отдельную ветку — они не группировались со среднеазиатскими вирусам и уж тем более ни с какими другими. Это был вирус и не A, и не B, и не 02AG. Разновидности ВИЧ-1, который мы все чаще выделяли от инфицированных людей в Новосибирской области, вообще не было в международной базе данных!

Когда мы поняли, что это какой-то новый вирус, у которого нет близких «родственников», мы расшифровали 17 полных геномов разных вариантов ВИЧ-1 (субтипа А, CRF02_AG, в том числе 8 новых вариантов вируса), выделенных нами от людей, инфицированных в Таджикистане, Узбекистане, Новосибирске, Красноярске, Кемерово, Краснодаре, Москве.

Обычно анализ генома ВИЧ проводится по 1/3-1/5 генома, а здесь мы полностью расшифровали вирус, от начала и до конца, сравнили расшифровки между собой и поняли, что восемь геномов ВИЧ-1 абсолютно идентичны.

Есть специальные компьютерные программы, которые позволяют анализировать вирус, сопоставляя кусочки его генома с геномами других вирусов. Такой анализ позволил доказать, что этот новый вирус частично такой же, как среднеазиатский CRF02_AG, а частично такой, как российский субтип А (теперь он называется А6). Таким образом, расшифровка структуры полного вирусного генома позволила понять, что эти два вируса скрестились и возник новый генетический вариант ВИЧ-1.

Первые образцы такого вируса были выделены нами от пациентов, инфицированных в 2003—2004 годах: видимо, он возник на рубеже 2000-х годов. В середине нулевых мы в Новосибирске стали выявлять его все больше и больше. Среди образцов крови, взятых у впервые выявленных людей с ВИЧ, в 2008 году мы находили такой вирус в 30% случаев, а после 2009-10 года количество людей, инфицированных этим типом ВИЧ, увеличилось до 80%», — отметила эксперт.

Наименование новому типу вируса было присвоено международными экспертами, которые проверили корректность проведенных в России исследований. Выявленный в Сибири ВИЧ-1 был назван CFR63_02А1. Цифра 63 обозначает, каким по счету этот рекомбинантный вирус был открыт, а 02А1 — прародители этого вируса.

Его опасность заключается в том, что он очень быстро распространяется.

«У нас сейчас выявляется все больше людей в острой стадии ВИЧ-инфекции, с очень высокой вирусной нагрузкой и выраженной лихорадкой. С одной стороны, такие люди более опасны для своих половых партнеров, так как вирус, присутствуя в большой концентрации, с большей вероятностью переходит к другому человеку.

С другой стороны, при таком начале заболевания люди чаще обращаются в медучреждения, где им могут быстро поставить правильный диагноз и назначить срочное лечение. Важно, что эти вирусы очень хорошо откликаются на антиретровирусную терапию: если пациенту своевременно назначить лечение, то вирусная нагрузка быстро снижается и человек начинает себя хорошо чувствовать.

Мы сейчас пытаемся понять, связано ли такое выраженное проявление ВИЧ-инфекции именно с нашим вирусом или, может быть, и вирусы субтипа А также мутировали. У нас есть единственная в России коллекция инфекционных вариантов ВИЧ — мы их выделяем у ВИЧ-инфицированных людей и исследуем их репродуктивные, биологические характеристики на клетках здоровых доноров, снимая графики роста. Мы начали эту работу еще в 2009 году: перед нами была поставлена задача создания коллекции вирусов, чтобы проверять на них разрабатываемые вакцины, противовирусные препараты — мы активно занимаемся этим совместно с фирмой «Фармасинтез».

Раньше никто не думал, что вирусы могут так быстро меняться. Анализ последних лет работы показал, что наши затраты сил, времени и финансов были оправданы. К тому же знание особенностей генома вирусов очень важно не только для эпидемиологии, но и для разработки тест-систем. Многие клинические тест-системы основаны на ПЦР-диагностике, а она, в свою очередь, — на знании нуклеотидной последовательности вирусов (вирусного генома). Все свои расшифрованные последовательности мы помещаем в международную базу данных. Эти данные общедоступны, и разработчики тест-систем могут пользоваться ими, чтобы смотреть, соответствует их тест-система изменчивости вирусов или нет», — добавила вирусолог.

По словам врача, часто ВИЧ-инфицированный думает: «Мне терять уже нечего!» Порой не торопится начинать лечение и не предохраняется при контактах с половыми партнерами, инфицированными ВИЧ. Но вирус размножается в человеке каждый час, попадая во все новые клетки, поэтому лучше не откладывать начало терапии: чем раньше начнется лечение, тем сохраннее остается организм и тем лучше ответ на терапию. В случае повторного инфицирования сразу активизируется процесс заболевания: ВИЧ-инфекция начинает вновь активно развиваться, сразу же сказываясь на здоровье человека.

«Раньше, в начале 2000-х, препаратов было мало, они были достаточно токсичными. Инфицированные ВИЧ люди думали, «Это все химиотерапия, да я лучше умру, чем буду ее принимать». Сейчас ситуация изменилась кардинально!

Я иногда говорю пациентам с ВИЧ: у меня высокое давление, я каждый день пью таблетки — и вы точно также пейте каждый день, по времени и будете жить нормально. Ну и что, что химия?», — отметила специалист.

Если терапия идет тяжело, можно менять схему лечения, заменив препараты. Если плохая переносимость лекарств, об этом просто нужно говорить врачу.

«Пора уже переходить к стабилизации эпидемии. Если раньше люди говорили «ой, как страшно!», то сейчас мы уже варимся в этой проблеме столько лет, что и врачи, и люди с ВИЧ-инфекций, и здоровые люди стали понимать важность этой проблемы. Самое главное, чтобы не было стигмы и хватало лекарств. Когда из нашей жизни исчезнет элемент дискриминации людей с ВИЧ, тогда они перестанут скрывать свой ВИЧ-статус.

И им будет проще, и общество не будет делиться — мы будем жить «одним коллективом», понимая главное: лечиться надо качественно. При качественном лечении темпы распространения заболевания будут снижаться. Мне кажется, уровень знаний населения уже значительно повысился, поэтому в ближайшее время надо ждать изменения ситуации в лучшую сторону. Я очень надеюсь, что это произойдет в ближайшее время», — заключила Наталья Гашникова.

Один из ведущих вирусологов России, заведующая лабораторией ретровирусов Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора (Новосибирск) Наталья Гашникова рассказала о тайной жизни этих вирусов.

«Разновидностей ВИЧ множество: так же, как люди делятся на разные расы, национальности, так и разные вирусы иммунодефицита различаются по структуре генома — генетического кода, который содержит всю информацию о вирусе. Геном вируса — это как хромосомы у человека, в которых зашифрована вся генетическая информация (какие у вас глаза, губы, рост и т. д.). Молекулярные эпидемиологи расшифровывают генетические коды вирусов и с помощью компьютерных программ сравнивают их, объединяя вирусы по идентичности их генома. Близкие группы вирусов называют субтипами.

Генетическую классификацию ВИЧ ввели вскоре после его открытия. Сначала определили девять основных групп, субтипов — A, B, C, D и т.д, и думали, что на этом все закончится. Но уже в начале 2000-х годов стало очевидно, что ВИЧ меняется. Когда вирус попадает в клетку человека, каждый цикл своего воспроизведения он делает с ошибкой. Считается, что без терапии у одного человека в сутки воспроизводится 10 в десятой степени новых вирусов. И каждый раз вирус при копировании своего генома может делать ошибку — так накапливаются точечные мутации», — пояснила специалист.

Но, кроме этого, оказалось, что вирусы могут и взаимодействовать друг с другом. Если в клетку человека попадает один вирус, а через какое-то время он заражается еще раз уже другим генетическим вариантом вируса (сначала был вирус, условно говоря, голубой, а потом попал красный), то такие вирусы могут частично обмениваться кусками своей информации (в результате может получиться уже вирус с мозаичной структурой генома, где чередуются красный и синий цвета). Это называется рекомбинантный вариант ВИЧ.

Такие варианты стали регистрировать еще в начале 2000-х годов, и некоторые рекомбинантные варианты получили очень широкое распространение в международной эпидемии — пандемии. Например, вирус CRF01_АЕ (это значит, что его прародительские формы — субтипы вируса А и Е), CRF02_AG, CRF03_АВ и т. д.

Сейчас в мире описано около 90 разных рекомбинантных форм вируса. Какие-то получают очень широкое распространение, а какие-то выявляются, но не дают большого «вклада» в эпидемию.

В России очень долго, примерно до 2008 года, почти на всех территориях распространялся вирус субтипа А. Он распространялся в обычной популяции (наркоманы и люди, получившие ВИЧ половым путем). Исключение составляли мужчины гомосексуальной ориентации, в группе которых циркулировал другой вирус — субтипа B: так сложилось исторически, потому что именно этот вирус в свое время попал в такую группу людей. Но сейчас ситуация очень сильно изменилась

«Мы, вирусологи «Вектора», постоянно занимаемся мониторингом циркулирующих ВИЧ. Организация находится в Новосибирске, поэтому данный регион (Новосибирская область) был нами максимально изучен. Тем более что мы с областным центром СПИДа находились на одной территории и у нас было налажено очень тесное сотрудничество. Начинали, когда в городе было еще всего 16 ВИЧ-инфицированных (а сейчас их примерно 36 тысяч). Ежегодно мы собирали образцы крови от недавно выявленных больных, расшифровывали фрагменты генома и анализировали, какие разновидности ВИЧ у нас выявляются. Именно это позволило нам в 2006 году зарегистрировать появление новой разновидности вируса. Мы не сразу поняли, что это новый вирус — технологии тогда еще не позволяли, секвенирование (расшифровка генома) было очень дорогим, малодоступным. Сначала мы думали, что мы увидели вирус, который, по данным научной литературы, выявлялся в странах Средней Азии — в Таджикистане, Узбекистане, Киргизии, Казахстане.

Но, кроме расшифровки генома, мы проводим еще и филогенетический анализ (специальная программа рисует «деревья» с ветвями, на которых объединяются близкие разновидности вируса). Расшифрованные последовательности образовывали отдельную ветку — они не группировались со среднеазиатскими вирусам и уж тем более ни с какими другими. Это был вирус и не A, и не B, и не 02AG. Разновидности ВИЧ-1, который мы все чаще выделяли от инфицированных людей в Новосибирской области, вообще не было в международной базе данных!

Когда мы поняли, что это какой-то новый вирус, у которого нет близких «родственников», мы расшифровали 17 полных геномов разных вариантов ВИЧ-1 (субтипа А, CRF02_AG, в том числе 8 новых вариантов вируса), выделенных нами от людей, инфицированных в Таджикистане, Узбекистане, Новосибирске, Красноярске, Кемерово, Краснодаре, Москве.

Обычно анализ генома ВИЧ проводится по 1/3-1/5 генома, а здесь мы полностью расшифровали вирус, от начала и до конца, сравнили расшифровки между собой и поняли, что восемь геномов ВИЧ-1 абсолютно идентичны.

Есть специальные компьютерные программы, которые позволяют анализировать вирус, сопоставляя кусочки его генома с геномами других вирусов. Такой анализ позволил доказать, что этот новый вирус частично такой же, как среднеазиатский CRF02_AG, а частично такой, как российский субтип А (теперь он называется А6). Таким образом, расшифровка структуры полного вирусного генома позволила понять, что эти два вируса скрестились и возник новый генетический вариант ВИЧ-1.

Первые образцы такого вируса были выделены нами от пациентов, инфицированных в 2003—2004 годах: видимо, он возник на рубеже 2000-х годов. В середине нулевых мы в Новосибирске стали выявлять его все больше и больше. Среди образцов крови, взятых у впервые выявленных людей с ВИЧ, в 2008 году мы находили такой вирус в 30% случаев, а после 2009-10 года количество людей, инфицированных этим типом ВИЧ, увеличилось до 80%», — отметила эксперт.

Наименование новому типу вируса было присвоено международными экспертами, которые проверили корректность проведенных в России исследований. Выявленный в Сибири ВИЧ-1 был назван CFR63_02А1. Цифра 63 обозначает, каким по счету этот рекомбинантный вирус был открыт, а 02А1 — прародители этого вируса.

Его опасность заключается в том, что он очень быстро распространяется.

«У нас сейчас выявляется все больше людей в острой стадии ВИЧ-инфекции, с очень высокой вирусной нагрузкой и выраженной лихорадкой. С одной стороны, такие люди более опасны для своих половых партнеров, так как вирус, присутствуя в большой концентрации, с большей вероятностью переходит к другому человеку.

С другой стороны, при таком начале заболевания люди чаще обращаются в медучреждения, где им могут быстро поставить правильный диагноз и назначить срочное лечение. Важно, что эти вирусы очень хорошо откликаются на антиретровирусную терапию: если пациенту своевременно назначить лечение, то вирусная нагрузка быстро снижается и человек начинает себя хорошо чувствовать.

Мы сейчас пытаемся понять, связано ли такое выраженное проявление ВИЧ-инфекции именно с нашим вирусом или, может быть, и вирусы субтипа А также мутировали. У нас есть единственная в России коллекция инфекционных вариантов ВИЧ — мы их выделяем у ВИЧ-инфицированных людей и исследуем их репродуктивные, биологические характеристики на клетках здоровых доноров, снимая графики роста. Мы начали эту работу еще в 2009 году: перед нами была поставлена задача создания коллекции вирусов, чтобы проверять на них разрабатываемые вакцины, противовирусные препараты — мы активно занимаемся этим совместно с фирмой «Фармасинтез».

Раньше никто не думал, что вирусы могут так быстро меняться. Анализ последних лет работы показал, что наши затраты сил, времени и финансов были оправданы. К тому же знание особенностей генома вирусов очень важно не только для эпидемиологии, но и для разработки тест-систем. Многие клинические тест-системы основаны на ПЦР-диагностике, а она, в свою очередь, — на знании нуклеотидной последовательности вирусов (вирусного генома). Все свои расшифрованные последовательности мы помещаем в международную базу данных. Эти данные общедоступны, и разработчики тест-систем могут пользоваться ими, чтобы смотреть, соответствует их тест-система изменчивости вирусов или нет», — добавила вирусолог.

По словам врача, часто ВИЧ-инфицированный думает: «Мне терять уже нечего!» Порой не торопится начинать лечение и не предохраняется при контактах с половыми партнерами, инфицированными ВИЧ. Но вирус размножается в человеке каждый час, попадая во все новые клетки, поэтому лучше не откладывать начало терапии: чем раньше начнется лечение, тем сохраннее остается организм и тем лучше ответ на терапию. В случае повторного инфицирования сразу активизируется процесс заболевания: ВИЧ-инфекция начинает вновь активно развиваться, сразу же сказываясь на здоровье человека.

«Раньше, в начале 2000-х, препаратов было мало, они были достаточно токсичными. Инфицированные ВИЧ люди думали, «Это все химиотерапия, да я лучше умру, чем буду ее принимать». Сейчас ситуация изменилась кардинально!

Я иногда говорю пациентам с ВИЧ: у меня высокое давление, я каждый день пью таблетки — и вы точно также пейте каждый день, по времени и будете жить нормально. Ну и что, что химия?», — отметила специалист.

Если терапия идет тяжело, можно менять схему лечения, заменив препараты. Если плохая переносимость лекарств, об этом просто нужно говорить врачу.

«Пора уже переходить к стабилизации эпидемии. Если раньше люди говорили «ой, как страшно!», то сейчас мы уже варимся в этой проблеме столько лет, что и врачи, и люди с ВИЧ-инфекций, и здоровые люди стали понимать важность этой проблемы. Самое главное, чтобы не было стигмы и хватало лекарств. Когда из нашей жизни исчезнет элемент дискриминации людей с ВИЧ, тогда они перестанут скрывать свой ВИЧ-статус.

И им будет проще, и общество не будет делиться — мы будем жить «одним коллективом», понимая главное: лечиться надо качественно. При качественном лечении темпы распространения заболевания будут снижаться. Мне кажется, уровень знаний населения уже значительно повысился, поэтому в ближайшее время надо ждать изменения ситуации в лучшую сторону. Я очень надеюсь, что это произойдет в ближайшее время», — заключила Наталья Гашникова.