Медики секвенировали геномы различных видов рака

Медики секвенировали геномы различных видов рака, чтобы классифицировать раковые клетки и, возможно, подбирать лечение в соответствии с этой классификацией.

Такую амбициозную цель поставили создатели проекта «Pan-Cancer Initiative» еще октябре 2012 г. Работы над проектом идут в рамках создания геномного атласа рака (the Cancer Genome Atlas (TCGA), над которым работали специалисты Национального института рака и Национального института исследования генома человека. Результаты первого этапа работы представлены в 18 статьях, четыре из которых опубликованы в журнале Nature Genetics.

Исследование потребовало скоординированной работы нескольких десятков научных групп. Ученые проанализировали данные нескольких тысяч пациентов с 12-ю типами опухолей. В этих опухолях учли все мутации, копийность генов и активность их работы, метаболические пути, в которых участвует каждый ген, степень метилирования ДНК, синтез микроРНК и белков, клиническую картину заболевания. Затем все данные объединили и постарались найти между ними связь.