ИИ научат анализировать внеклеточную РНК для поиска заболеваний и лекарств

Биотехнологическая компания Network Bio объявила о сотрудничестве с NVIDIA для разработки базовой модели, обучаемой на данных о внеклеточной РНК. Компании объединят биологические и клинические данные Network Bio с вычислительными технологиями NVIDIA. Проект направлен на ускорение диагностики заболеваний, поиска биомаркеров и разработки лекарств.

Внеклеточная РНК, циркулирующая в крови, отражает актуальную экспрессию генов в тканях в реальном времени. По данным Network Bio, один образец крови содержит сотни миллионов транскрипционных наблюдений, что создает значительный объем данных для анализа. Компания ранее разработала модели Exai-1 и Orion, способные анализировать такие данные. Orion, по данным компании, выявляла рак легких на ранней стадии с чувствительностью 94% и специфичностью 87%.

В рамках сотрудничества компании масштабируют обучение модели Nexus — трансформера с самоконтролируемым обучением, работающего с профилями экспрессии cfRNA. Для этого будут использоваться технологии NVIDIA BioNeMo, а NVIDIA Parabricks — для анализа, выравнивания, количественной оценки и контроля качества образцов. По данным Network Bio, интеграция Parabricks уже сократила время обработки образцов и вычислительные затраты.

Модель планируют использовать как основу для последующих решений в онкологии и других терапевтических областях. Network Bio намерена интегрировать ее со своей платформой Bio-Native AI для изучения механизмов заболеваний, поиска биомаркеров и разработки диагностических и терапевтических решений.

Ранее NVIDIA сообщила о расширении присутствия в биомедицине благодаря BioNeMo Agent Toolkit — программному инструменту, который позволяет ИИ-агентам самостоятельно вызывать вычислительные модели для работы с белками, молекулами и геномами. Сообщалось, что более 50 биотехкомпаний, включая Eli Lilly, Schrödinger и Thermo Fisher, уже интегрируют этот набор инструментов в свои рабочие процессы.