Глубокое секвенирование позволило открыть новый вирус

Метод глубокого секвенирования позволил международной группе ученых открыть новую разновидность рабдовирусов, вызывающих заболевание бешенством у животных и человека. Однако новый член этого семейства, названный первооткрывателями "вирус Бас-Конго" (Bas-Congo virus, BASV), явился возбудителем ранее неизвестного вида геморрагической лихорадки, локальная вспышка которой произошла в конголезской деревне в 2009 году. Работа опубликована в сентябрьском выпуске журнала PLoS Pathogens.

Вспышка заболевания, по симптомам похожего на острую геморрагическую лихорадку, была зафиксирована в деревне Мангала, Демократическая республика Конго, и продлилась с 25 мая по 14 июня 2009 года. Заболели три жителя деревни, двое из которых умерли через три дня после начала болезни, а третий, медбрат, ухаживавший за больными в местном госпитале, выжил.

Образцы крови выжившего были отправлены в Институт биомедицинских исследований в столице Конго, Киншасе, затем перенаправлены в Габон, в Международный центр медицинских исследований, однако ни там, ни там возбудителя заболевания выделить не удалось, так как между забором крови и попаданием ее к специалистам прошло слишком много времени. Затем эти образцы были направлены в Сан-Франциско, в Институт исследования кровеносной системы.

Там ими занималась группа под руководством Эрика Дэлварта (Eric Delwart), которая попыталась обнаружить ДНК вируса методом полимеразной цепной реакции (ПЦР). Они убедились, что возбудитель относится к семейству рабдовирусов, но дальнейший процесс застопорился из-за недостаточного генетического материала. Группа Дэлварта передала образцы Чарльзу Чиу (Charles Chiu), главе Центра по обнаружению вирусов Калифорнийского университета. Чиу и его коллегам удалось полностью реконструировать геном вируса BASV, собрав его из секвенированных ими 140 миллионов фрагментов генетического материала.

Исследователи установили, что концентрация BASV в крови единственного перенесшего инфекцию превышала миллион копий на миллилитр. Филогенетический анализ показал, что BASV существенно отличается от других рабдовирусов, менее, чем на 34 процента совпадая с ними по последовательности аминокислот.

Реальность существования BASV также была подтверждена тем, что в крови выжившего и в крови двух ухаживавших за ним в период болезни, но не заболевших медработников был обнаружен высокий уровень содержания антител к этому вирусу. Этот факт также дает основания предположить, отмечают авторы, что вирус может передаваться от человека к человеку, однако источник вируса и способ передачи пока неизвестны.