Более 90% вирусов кожи человека плохо изучены
Структура кожи. Фото: Alexander_P/Shutterstock.com
Исследования микробиома все чаще показывают, что микроорганизмы, обитающие внутри и на поверхности человеческого тела, важны для организма. Сейчас ученые из Перельмановской медицинской школы при Университете Пенсильвании (Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania) исследовали популяции вирусов — виром.
Элизабет Э. Грайс (Elizabeth A. Grice) отмечает, что раньше подобных работ проводилось очень мало из-за технических ограничений: обычный кожный мазок содержит в основном человеческую и бактериальную ДНК, и лишь малую его часть составляет генетический материал вирусов.
В исследовании брали пробы с ладоней, лба, подмышек, пупка и других частей тела 16 здоровых человек. Ученые воспользовались методами выделения вирусоподобных частиц и анализировали очень небольшое количество генетического материала вируса. Чаще других встречался папилломавирус человека. Однако, более 90% обнаруженных вирусных генов отсутствовали в базах данных и были плохо изучены. Наиболее разнообразный набор вирусов был обнаружен на сгибе руки.
Кроме того, большая часть вирусной ДНК принадлежала бактериофагам – вирусам, поражающим бактериальные клетки. Это свидетельствует о взаимосвязи между кожным микробиомом и виромом. Секвенирование бактериальной ДНК, выделенной из образцов, взятых с кожи 16 участников эксперимента, показало, что в геноме бактерий присутствуют CRISPR-повторы, свидетельствующие об атаке фагов на кожные бактерии. Все это свидетельствует о тесном взаимодействии вирома и микробиома.
В ближайшее время ученые планируют идентифицировать вирусы, присутствующие на коже человека, а также изучить, как прием антибиотиков, действие ультрафиолета и другие факторы влияют на виром.
Scientists in recent years have made great progress in characterizing the bacterial population that normally lives on human skin and contributes to health and disease. Now researchers have used state-of-the-art techniques to survey the skin’s virus population, or «virome.»
