BioNTech и InstaDeep разрабатывают систему раннего предупреждения SARS-CoV-2

Недавно стало известно, что биотехнологическая компания BioNTech совместно с InstaDeep представили новую разработку – систему раннего предупреждения (EWS), представляющую собой вычислительный метод для анализа данных секвенирования по всему миру и построения прогнозов относительно штаммов SARS-CoV-2 с высоким риском. Пишет PMLiVE.

Компании работают с использованием искусственного интеллекта (ИИ), на основании расчетов показателей иммунной защиты и приспособленности. Алгоритмы ИИ комбинируются со структурной основой спайкового белка вируса, чтобы предупредить о наличии потенциально опасных вариантов, введенных в архивы данных о последовательностях SARS-CoV-2 менее чем за день.

В течение пробного периода система EWS выявила более 90% вариантов, обозначенных Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) – альфа, бета, гамма, тета, эта и омикрон – в среднем заблаговременно за 2 месяца. Те же штаммы были обнаружены системой на той же неделе, когда их последовательность была первоначально загружена, с омикрон-штаммом, отнесенным к категории высокого риска в тот же день, когда его последовательность стала доступна.

Система раннего предупреждения оценивает варианты SARS-CoV-2 исключительно на основе существующих данных, убирая необходимость в получении дополнительной информации. Прогнозы поддерживаются доказательствами с использованием экспериментальных сведений, полученных как с помощью внутренних средств в Лондоне, так и на базе общедоступных фактов.