Исследование провели специалисты НМИЦ гематологии, Филатовской ГКБ в Москве, Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова и факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ совместно с коллегами из Института молекулярной биологии Национальной академии наук Республики Армения и Армянского института биоинформатики.
При проведении исследования ученые сравнили особенности генотипов HLA-I пациентов с COVID-19 первой и третьей волн пандемии, вызванной штаммом коронавируса «дельта». Анализировались геномы 147 пациентов, переболевших COVID-19 в период первой волны (с мая по август 2020 года) и 219 пациентов – третьей волны (с июня по июль 2021-го).
Для анализа генотипа и для типирования генов HLA ученые использовали метод секвенирования NGS, позволяющий определить, какие варианты генов (аллели) из всех возможных имеются у конкретного человека. Затем исследователи сравнивали, как часто тот или иной аллель встречается в группах.
Специалисты установили, что частота носителей аллеля HLA-A*01:01 снизилась вдвое среди пациентов третьей волны по сравнению с первой. Другие варианты генов HLA-I встречались одинаково часто в обеих группах.
Ранее считалось, что аллель HLA-A*01:01 связан с более высоким риском заражения и более тяжелым течением COVID-19. Однако ученые пришли к выводу, что снижение его встречаемости среди заболевших в третью волну отражает ранее сформировавшийся Т-клеточный иммунитет к COVID-19 у его носителей. Специалисты предполагают, что эти выводы могут стать основой для разработки новых вакцин от COVID-19.
Исследование провели специалисты НМИЦ гематологии, Филатовской ГКБ в Москве, Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова и факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ совместно с коллегами из Института молекулярной биологии Национальной академии наук Республики Армения и Армянского института биоинформатики.
При проведении исследования ученые сравнили особенности генотипов HLA-I пациентов с COVID-19 первой и третьей волн пандемии, вызванной штаммом коронавируса «дельта». Анализировались геномы 147 пациентов, переболевших COVID-19 в период первой волны (с мая по август 2020 года) и 219 пациентов – третьей волны (с июня по июль 2021-го).
Для анализа генотипа и для типирования генов HLA ученые использовали метод секвенирования NGS, позволяющий определить, какие варианты генов (аллели) из всех возможных имеются у конкретного человека. Затем исследователи сравнивали, как часто тот или иной аллель встречается в группах.
Специалисты установили, что частота носителей аллеля HLA-A*01:01 снизилась вдвое среди пациентов третьей волны по сравнению с первой. Другие варианты генов HLA-I встречались одинаково часто в обеих группах.
Ранее считалось, что аллель HLA-A*01:01 связан с более высоким риском заражения и более тяжелым течением COVID-19. Однако ученые пришли к выводу, что снижение его встречаемости среди заболевших в третью волну отражает ранее сформировавшийся Т-клеточный иммунитет к COVID-19 у его носителей. Специалисты предполагают, что эти выводы могут стать основой для разработки новых вакцин от COVID-19.