Американские ученые описали структуру фермента, убирающего метилирование, передает научно-популярный журнал «Наука 21 век» со ссылкой на статью, опубликованную в научном журнале Nature.
Ученые впервые подробно описали молекулярную структуру одного из ферментов семейства Tet. Это открытие имеет важное значение для исследований эпигенетики, так как Tet-энзимы меняют химический состав ДНК.
Эти ферменты попали в поле внимания ученых лишь в последние пять лет. Благодаря ним стволовые клетки удерживаются в состоянии мультипотентности; они участвуют в ранних стадиях развития эмбриона, а также в формировании злокачественных опухолей.
С помощью рентгенокристаллографии ученые определили структуру Tet-фермента одноклеточного Naegleria gruberi. Он показал, как фермент взаимодействует с ДНК, сгибая ее двойную спираль и вытаскивая основание, которое должно быть модифицировано.
Naegleria gruberi — это одноклеточный организм, обитающий в почве и пресной воде; он принимает форму амёбы или флагеллата. Naegleria fowleri — его близкий родственник — вызывает смертельно опасные болезни мозга. Ученые решили изучать Tet-фермент из Naegleria gruberi из-за того, что он меньше (и поэтому легче кристаллизируется), чем у млекопитающих. Однако последовательность белков в нем не сильно отличается от аналогичного фермента млекопитающих.
Tet-ферменты млекопитающих обладают лишней регулирующей областью, которой одноклеточные лишены. Понимание принципов ее работы — следующий этап исследований.