Результаты одного из первых исследований по определению влияния предоперационной или неоадъювантной химиотерапии на геном рака молочной железы предлагают два ключевых момента. Один из них — результаты до лечения, которые могут помочь предсказать, какие пациенты больше всего выиграют от предоперационной химиотерапии, а другой — результаты после лечения, которые проливают свет на то, как раковые клетки выживают при химиотерапии. Результаты появляются в Клинические исследования рака,
SWOG Cancer Research Network сделала работу возможной. Десять лет назад команда SWOG запустила S0800, инновационное испытание, в котором сравнивались две 20-недельные химиотерапия лечение перед операцией для пациентов с HER2-отрицательным, местно-распространенным или воспалительным раком молочной железы. Для исследования образцы опухолевой ткани были взяты до и после химиотерапии и сохранены в банке биологических образцов SWOG, который открыт для ученых всего мира.
Исследователи SWOG Лайош Пуштай, доктор медицины, и Райан Поулз, доктор философии, оба в Йельском онкологическом центре, когда проводилось исследование, использовали эти накопленные образцы для проведения своего исследования. Они представили образцы для полного секвенирования экзома, лабораторного метода, который каталогизирует кодирующие белок области генома, небольшую часть человеческого генома, известную как экзом.
В своем исследовании Pusztai и Powles проанализировали 29 биопсий до лечения, начиная с S0800, чтобы выявить мутационные паттерны ДНК, а затем проанализировали реакцию химиотерапии после лечения, чтобы увидеть, появились ли какие-либо паттерны. Они обнаружили, что пациенты, у которых рак молочной железы был полностью ликвидирован химиотерапией, имели более высокую долю мутационной «сигнатуры 3» ДНК, паттерна, который указывает на дефекты репарации ДНК и мог быть вызван повреждением таких генов, как BRCA.
«Это ключ», — сказал Паулс, бывший доктор философии. студент в лаборатории Pusztai в Йельском университете, а теперь исследователь в Bristol-Myers Squibb. «Врачи могут посмотреть на результаты генетического тестирования, чтобы увидеть, кто из их пациентов с раком молочной железы может ответить лучше всего на неоадъювантная химиотерапияи каким пациентам может потребоваться другой или дополнительный курс лечения «.
Для анализа после лечения Pusztai и Powles смогли проанализировать только девять из 29 образцов до и после химиотерапии. Это потому, что лечение убило так много опухолевые клетки что большинство образцов были слишком малы для изучения Тем не менее, девять оставшихся образцов были хорошо подходят для изучения устойчивости к химиотерапии. Команда SWOG не нашла один ген или генная мутация, присутствующая в опухолевой ткани, которая выжила после химиотерапии. Скорее, эти опухолевые клетки имели мутации, которые принадлежали двум биологическим путям — мишеням E2F и контрольной точке G2M. Эти пути представляют собой наборы генов, которые действуют вместе, чтобы регулировать рост клеток, процесс, который может вызвать рак, если он пойдет не так.
«Что важно в этой статье, так это то, что она демонстрирует, что хотя каждый рак приобретает мутации в разных генах, затронутые гены не случайны», — сказал Пуштай, председатель исследовательского комитета SWOG по исследованиям рака молочной железы и директор по груди рак трансляционные исследования в Йельском онкологическом центре. «Рак ячейки у всех, кто пережил химиотерапию, были изменения в регуляции роста клеток на разных уровнях. Итак, пока гены могут отличаться, они делают ту же работу. »