Химики разобрались в структуре ключевого белка коронавируса

Специалисты одной из химических лабораторий MIT долгое время занимались изучением одного из белков гриппа, который имеет много общего с белками вируса SARS-CoV-2, в частности, с белком Е. За 2,5 месяца они научились клонировать и очищать коронавирусный белок Е, пишет MIT News.

Для того чтобы определить его структуру, ученые поместили белок в липидный бислой, похожий на клеточную мембрану, а затем проанализировали его с помощью технологии ядерного магнитного резонанса (ЯМР). Было установлено, что часть белка Е собирается в пучок из пяти спиралей. Они остаются по большей части неподвижными внутри пучка, образуя более плотный канал, чем у белка гриппа.

Любопытно, что белок Е вируса SARS-CoV-2 выглядит совсем не похожим на ионные каналы гриппа или ВИЧ-1. В вирусах гриппа эквивалентный белок намного подвижнее, а у ВИЧ-1 он короче, с более широкими порами. Как эти структурные отличия воздействуют на функции SARS-CoV-2 — это вопрос, ответ на который ученые намерены найти в ближайшем будущем.

Также исследователи из MIT идентифицировали несколько аминокислот на концах канала, которые могут притягивать в канал положительно заряженные ионы, например, кальция. Они полагают, что структура, которую они описали, это канал в закрытом состоянии, и теперь надеются определить структуру открытого состояния, которая должна пояснить, как этот канал открывается и закрывается.

Вдобавок они обнаружили, что два препарата — амантадин, которым лечат грипп, и гексаметиленамилорид от высокого давления — блокируют белок Е, хотя и не самым эффективным образом. Если будут разработаны более мощные ингибиторы, они могут стать лекарством для лечения COVID-19.

В начале осени ученые из США создали эффективный и стабильный противовирусный препарат, блокирующий коронавирусную инфекцию как минимум не хуже моноклональных антител, но более надежный и простой в производстве. Он предотвращает проникновение вируса в клетки организма.