Специалисты Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора разработали панель на основе секвенирования нового поколения, которая позволяет одновременно выявлять 27 мишеней — 26 респираторных вирусов и их типов, а также вирус кори. Об этом сообщил к.б.н., заведующий лабораторией геномных исследований ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов на форуме OpenBio.
В отличие от стандартных ПЦР-тестов, рассчитанных на ограниченный набор возбудителей, новая технология позволяет искать широкий спектр вирусов в одном образце. При этом исследование дает возможность определить генетический вариант или субтип обнаруженного возбудителя и выявить значимые мутации.
«ОРВИ — это собирательный синдром, который вызывается десятками различных вирусов. Сейчас коронавирус, грипп и еще ряд возбудителей диагностируются достаточно широко, а значительная часть других вирусов остается за пределами стандартного тестирования», — сказал Хафизов.
По его словам, технология может быть востребована при тяжелом или нетипичном течении инфекции, когда стандартная диагностика не позволяет установить причину заболевания, а также при подозрении на заражение несколькими возбудителями одновременно и при расследовании вспышек.
После поступления образцов в лабораторию весь анализ, включая подготовку материала и секвенирование, потенциально можно проводить в течение суток. При этом разработчики рассчитывают сделать технологию достаточно дешевой для практического применения.
Сейчас панель используется в рамках научных исследований и еще не применяется для постановки медицинского диагноза: для внедрения необходимо зарегистрировать медицинское изделие.
В дальнейшем специалисты планируют создавать аналогичные панели для диагностики острых кишечных инфекций, инфекций центральной нервной системы, детских экзантем и других заболеваний.
Разработка опирается на созданную ЦНИИ эпидемиологии систему геномного эпидемиологического надзора VGARus, которая объединяет около 500 тыс. геномных последовательностей различных возбудителей.
