При размещении товаров на конкурсе или аукционе этот порядок в некоторых случаях не применяется, в частности, если в рамках одного конкурса или аукциона предполагается поставка нескольких видов товаров, только часть из которых входит в упомянутый перечень видов товаров, либо в том случае, если заказчик размещает заказ у единственного поставщика в результате признания несостоявшимися конкурса или аукциона, а также в ряде случаев, когда иностранные товары не составляют конкуренции российским и белорусским.
Аналогичный приказ действовал и в 2011 г., однако подписан он был в мае, а зарегистрирован в конце июня, из-за чего российские компании были лишены возможности использовать данное преимущество при поставке лекарственных средств.
7 февраля 2012 г. Ассоциация российских фармацевтических производителей обратилась к министру экономического развития Эльвире Набиуллиной с просьбой о продлении действия приказа в максимально короткие сроки до начала проведения аукционов на второе полугодие 2012 г.
