Ученые из сингапурского Института генома во главе с профессором Патриком Таном (Patrick Tan) разработали новую методику, позволяющую понять, как работают здоровые и раковые клетки желудка. Авторы считают, что новый подход можно использовать для ранней диагностики онкологических заболеваний желудка.
Новый метод позволил исследователям проанализировать множество мутаций, обнаруженных в образцах, взятых у больных с первичными аденокарциномами желудка пяти разных типов. Полученные данные они сравнили с информацией, полученной при анализе нормальных тканей.
Одними из основных маркеров онкологических заболеваний является присутствие изменений, затрагивающих хроматин, в частности — модификации гистонов. Гистоны — белки, необходимые для упаковки нитей ДНК, а также участвующие в эпигенетической регуляции процессов транскрипции и репликации, происходящих в клетке.
Авторы обнаружили более сотни соматических изменений в промоторах, которые и приводили к изменению профиля экспрессии. Многие промоторы, обнаруженные в раковых клетках, утратили свои первоначальные функции и участвовали в инициации транскрипции ряда генов, активизирующихся во время эмбрионального развития, при дифференцировке тканей.
Исследователи подчеркивают, что предложенный ими метод позволяет различить раковые и здоровые клетки, а также способен выявить особенности, характерные для онкологических заболеваний желудка у жителей разных стран. В настоящее время известно, что некоторые типа рака чаще встречаются в Азии, чем в западных странах, однако о причинах возникновения этих различий известно довольно мало. Ученые считают, что новая методика сможет дать ответ и на этот вопрос.
