Евгений Филиппов стал фигурантом уголовного дела о мошенничестве в особо крупном размере с использованием служебного положения в марте 2026 года. Следователи отмечали – чиновник с ноября 2015 по декабрь 2025 года был фиктивно трудоустроен в медвузе, а также незаконно получал зарплату. Сразу после задержания Филиппова отправили в СИЗО.
Региональная прокуратура тогда обратилась в суд с иском об обращении имущества Филиппова и его родственников в доход государства. Уточнялось, что в собственности у них числится 57 объектов недвижимости в Краснодаре, Геленджике, Сочи, Красной Поляне и федеральной территории «Сириус» стоимостью более 1 млрд рублей. Октябрьский райсуд в апреле постановил обратить активы Филиппова и его семьи стоимостью 1,9 млрд рублей в доход государства.
Судебный процесс по уголовному делу начался в июне. Экс-чиновник признал вину в том, что числился заведующим кафедрой иммунологии, не исполняя свои обязанности в полном объеме.
Минздравом Краснодарского края Евгений Филиппов руководил с 2013 года. Он ушел в отставку сразу после задержания. Временным руководителем ведомства тогда стала первый заместитель министра Ирина Вязовская. В мае временно исполнять обязанности министра начал замглавврача Краевой больницы № 2 Владимир Крушельницкий. В середине июня его утвердили в должности.
